生物工程专业，普通本科，专业代码083001，学制四年，授予工学学士位。

生物工程专业为山东省一流专业、山东省高水平应用型建设专业、菏泽学院特色专业；以该专业为依托，获批山东省高校协同创新中心（对接产业类）-鲁西南高效特色循环生态农业协同创新中心，山东省高校青创人才引育计划-生物应用技术创新团队等建设项目。同时，该专业已申请教育部“双百计划”项目认证和工程教育认证。

自2005年7月开始招生，经过10多年的建设和发展，已经形成了先进的人才培养理念、创新的课程体系、高水平的师资队伍、完善的实验实训条件、优质的实习实践基地，为专业应用型人才培养奠定了良好的基础，在生物工程领域积累了较为丰富的人才培养与专业实践经验。

培养目标：本专业根据学校“特色鲜明高水平应用型大学”的办学定位，立足菏泽，面向周边，辐射全国，服务区域社会发展，培养德、智、体、美、劳全面发展的社会主义事业合格建设者和接班人。秉承社会主义核心价值观，具有强烈社会责任感、理论基础扎实、富有人文素养、科学精神和实践能力，具有创新能力和持续学习能力，能够解决生物工程领域的复杂工程问题，可以在发酵食品、生物医药、现代农业等领域从事生产、设计、管理和新技术研究、新产品开发等工作，具有国际视野的高素质应用型工程技术人才。

主要课程：普通生物学、工程图学、化工原理、微生物学、生物化学、细胞生物学、分子生物学、发酵工程、酶工程、基因工程、生物反应工程、生物分离工程、生物工程设备、发酵工厂设计等。

专业特色：该专业学生理论基础扎实，专业和实践能力强，毕业后服务于生物医药、生物发酵及大健康产业行业，五届毕业生考研率达40%。

  就业方向：工业、农业、医药、食品、环保等行业高新技术企业和生物发酵相关产业。